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            利用機器學習算法,我科學家準確預測了紫花苜蓿秋眠性

            2022-11-14 07:42:01 來源:工人日報客戶端


            【資料圖】

            原標題:利用機器學習算法,我科學家準確預測了紫花苜蓿秋眠性

            工人日報-中工網記者 黃哲雯 通訊員 付松川

            近日,中國農業科學院北京畜牧獸醫研究所飼草育種與栽培科技創新團隊,探索機器學習算法在紫花苜蓿基因組預測中應用的可行性,構建基于紫花苜蓿秋眠性狀基因組的最佳預測模型,準確預測了紫花苜蓿秋眠性,為利用基因組預測方法開展紫花苜蓿分子育種提供了重要參考。

            紫花苜蓿被譽為“牧草之王”,是草食動物的重要蛋白牧草。秋眠性是影響紫花苜蓿秋季再生性和產量的重要性狀,對紫花苜蓿育種具有重要價值。為探索機器學習算法在紫花苜?;蚪M預測應用方面的可行性,該研究以全基因組關聯分析鑒定到的分子標記為依據,利用候選SNP位點進行秋眠性表型預測,同時結合機器學習算法獲得類似于基于表型選擇的預測準確率。

            研究人員對5種預測模型進行了分析比較和交叉驗證,發現SVM linear預測模型具有高準確率和最佳回歸系數。進一步利用單株個體秋眠性表型預測品種內平均表型,結合單株個體秋眠性GWAS關聯SNP標記和SVM linear模型進行平均表型預測,結果表明預測準確率可達64.1%。

            相關研究成果發表在《園藝研究(Horticulture Research)》上。該研究得到國家自然科學基金、國家牧草產業技術體系、內蒙古科技重大專項和國家公派留學等項目的資助。

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